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益生菌酸奶可以改善胃肠不适等症状，但有关专家提醒，食用含益生菌酸奶应注意“三忌”：加热、空腹和过量。
益生菌要在一定温度下才能保持活性，因此一般要冷藏。喝酸奶时如果加热，益生菌的作用就会受到影响。
如果想用酸奶来解决便秘、消化吸收不好等问题，吃酸奶时也不能空腹，因为空腹时酸奶会和胃酸直接接触，胃酸会把益生菌杀死，难以起到调节肠道菌群的作用。
针对食用益生菌酸奶是不是多多益善的问题，专家表示，并不是越多越好，一方面是吃多了益生菌在肠道中也不能存活，另一方面还要考虑胃的生理功能和承受能力。
尽管益生菌的作用已得到科学界认定，但迄今我国尚无益生菌酸奶的标准，益生菌酸奶的标识、标签以及市场都亟须规范。